肿瘤

Sci Rep:研究确定卵巢癌中差异表达的LncRNA

作者:佚名 来源:MedSci梅斯 日期:2017-09-13
导读

          癌相关成纤维细胞(CAFs)与卵巢癌预后较差相关。与肿瘤细胞不同,CAFsDNA突变很罕见,增加了其他调节基因(如长非编码RNAs的可能性(lncRNAs))表达机制的可能性。本研究旨在确定促进CAFs的肿瘤促进表型的lncRNA。

关键字:  卵巢癌 

        癌相关成纤维细胞(CAFs)与卵巢癌预后较差相关。与肿瘤细胞不同,CAFsDNA突变很罕见,增加了其他调节基因(如长非编码RNAs的可能性(lncRNAs))表达机制的可能性。本研究旨在确定促进CAFs的肿瘤促进表型的lncRNA。

        研究共纳入了67个卵巢CAF标本和10个正常卵巢细胞(NOF)样本进行RNA表达分析,以识别差异表达的lncRNA,并构建功能网络以预测参与转移CAF特异性lncRNAs。

        基因表达芯片共检测出1970个可供分析的lncRNAs,其中39个特异性lncRNAs在CAF与NOFS中差异表达。使用多变量模型评估鉴别差异表达lncRNA的预测能力。已知的转录因子相互作用,转录因子基因相互作用,以及构建一个上下游特定的相互作用网络来确定多种lncRNAs可能在转移中发挥重要作用。

        总之,该研究发现了卵巢癌中差异表达的lncRNAs,并可有助于预测CAF转移促进表型。

        原始出处:

        Fatemeh Vafaee, Emily K. Colvin, et al.Functional prediction of long non-coding RNAs in ovarian cancer-associated fibroblasts indicate a potential role in metastasis.Sci Rep. 2017; 7: 10374. Published online 2017 Sep 4. doi: 10.1038/s41598-017-10869-y

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