肿瘤

中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱绘制完成

作者:孙国根 来源:医学论坛网 日期:2022-06-16
导读

         复旦大学丁琛教授团队携手复旦大学附属肿瘤医院叶定伟教授团队和上海交大医学院附属新华医院赵健元教授团队,对232例中国肾癌患者人群的肾透明细胞癌进行蛋白质基因组学测序分析,并结合患者临床病理特征和生存数据,研究肾癌的分子特征并进行分子分型,终成功绘就中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱,首次发现中西方透明肾癌患者关键致病基因突变谱的差异,并根据蛋白质基因组特征成功进行分子分型,对提高肾癌疗效、实现精准治疗有重大意义。

       本网讯 (驻地记者 孙国根  通讯员 王懿辉 王广兆)复旦大学丁琛教授团队携手复旦大学附属肿瘤医院叶定伟教授团队和上海交大医学院附属新华医院赵健元教授团队,对232例中国肾癌患者人群的肾透明细胞癌进行蛋白质基因组学测序分析,并结合患者临床病理特征和生存数据,研究肾癌的分子特征并进行分子分型,终成功绘就中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱,首次发现中西方透明肾癌患者关键致病基因突变谱的差异,并根据蛋白质基因组特征成功进行分子分型,对提高肾癌疗效、实现精准治疗有重大意义。4月19日,相关研究成果已在线发表于最新一期 国际学术期刊《自然 · 通讯》 (Nature Communications)上。

        叶定伟说,肾透明细胞癌来源于肾小管上皮细胞的腺癌,是最常见的肾癌病理亚型,约占肾癌的60%-85%。尽管肾癌的早期诊断和治疗水平近年来有所提高,但在诊断方面,仍有约60%的患者初诊时即为转移性肾癌或在疾病随访过程中出现远处转移,对患者生命造成重大威胁。肾癌对放射治疗并不敏感。在治疗上,目前晚期肾癌的治疗反应率已从靶向治疗时代的30%左右提高至靶向-免疫联合时代的50-70%。然而并非所有肾癌患者均对靶向-免疫联合联合治疗有效,即便是初始治疗有效的患者大部分也会出现继发耐药。究其原因,肾癌是一种高度遗传异质性的恶性肿瘤,这些携带不同基因突变谱和遗传表型的肿瘤细胞的生物学行为以及对治疗的敏感性不尽相同。因此,研究肾癌的分子特征并进行分子分型,是提高肾癌治疗疗效、实现肾癌精准治疗的关键。

        2019年美国公布了103例透明细胞肾癌患者的蛋白质基因组学特征,为欧美国家的肾癌精准治疗提供了依据。但该研究人群集中在西方肾癌患者上,在治疗方式、药物使用上同国内的患者存在差距,因而不能满足国内肾癌临床和基础研究中的迫切需求。

        为了解决上述瓶颈问题,联合研究团队在上海市级科技重大专项“国际人类表型组计划”、科技部重点研发计划等资助下,针对中国人肾透明细胞癌特征展开专项研究。

        该研究首次通过大样本队列绘制了中国透明细胞肾癌的蛋白质基因表达图谱。研究发现中国人群肾癌关键致病基因的突变频率与欧美人群存在显著差异,相比于欧洲队列中突变率最高的是VHL和SETD2基因,TCGA队列中是PBRM1和MTOR基因;而中国队列中突变率最高的基因是PBRM1和SETD2。蛋白质组分析显示,与癌旁组织相比,透明细胞肾癌组织表现出广泛的代谢失调和增强的免疫反应。 联合研究团队将透明细胞肾癌分为三种亚型:GP1表现为免疫反应最强(免疫浸润型),GP2表现为代谢重塑最强(代谢重塑型),GP3具有最多的细胞外基质成分(间质为主型)。其中GP1亚型的恶性程度最高、侵袭性最强、最易发生转移、预后最差,提示临床上需要更加积极的治疗。

        联合研究团队在肾癌发生分子机制研究中进一步发现,NNMT酶作为一种重要的甲基化催化酶,可以激活DNA损伤修复关键蛋白的活性,增强DNA修复,进而促进肾癌细胞增殖。这一发现提示NNMT不仅可作为透明细胞肾癌潜在的生物标记物,还是GP1亚型潜在的药物靶点。

        丁琛表示,该研究还首次发现代谢紊乱与透明细胞肾癌发生发展的因果关系,为阐明透明细胞肾癌的发生发展机制和精准治疗提供全新视角,并为肾癌放射治疗不敏感这一临床现象提供了可能的解释。

        论文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-022-29577-x

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